六識の倶有依は意根であり、意根の倶有依は如来蔵である。如来蔵が直接に意根を出生し保持するゆえに、意根は存在し続け、絶え間なく運行することができる。如来蔵は一切の法を直接に出生し、一切の法の倶有依もまた如来蔵である。如来蔵がなければ、一切の法の存在と運行はあり得ない。しかし如来蔵は意根に依らなければ運行することができず、一切の法を出生することも、如来蔵の運行と行相を顕現させることもできない。したがって意根は如来蔵が諸法を運行するための倶有依であって、如来蔵を出生する倶有依ではない。なぜなら如来蔵は本来より存在し、出生を必要とせず、意根も如来蔵を生じることはできないからである。
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