意根の機能は主として作主性、つまり決定権を持つことであり、これは誰にもどうすることもできません。如来蔵の機能は法爾如是であり、種子があり、資源があってこそ、一切の法を変造し、維持することができるのです。意根に思いがある限り、如来蔵はできる限りそれに配合します。これこそが意根の強大な我性と作主性、そして如来蔵の随縁性と無我性を示しているのです。意根と如来蔵は、影が形に随うようにして在ります。唯識の法を多く学べば、将来開悟する時に、非常に深く、非常に透徹して悟ることができ、根源まで悟ることができます。学んだ法が浅ければ、悟りも浅くなります。もし初禅の定(じょう)があれば、開悟の時に十行位、十回向位にまで到達できるかもしれません。
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