意根が疑を断じて信を生じてこそ、如来蔵 (tathāgatagarbha) ははじめて随順する

一切万法は如来蔵 (tathāgatagarbha) を離れず、意根を離れて有することはなく、意識はただ補助的な役割を果たすにすぎない。意識は参謀という脇役のようなものであり、意根こそが主人公であり、将軍のようなものである。すべての決定権は意根にかかっている。意識は参謀として、絶えず意根のために六塵の情報を収集し、六塵の詳細な情報を分析し、意根に適切で、時宜を得た、合理的な助言を与えなければならない。

意根は意識が分析した情報と助言を受け取った後、自ら特有の思考加工と考量を行い、意識の言う通りに六塵を処理するかどうかを決める。あるいは意根自身の経験に依り、自分の習慣に依り、自分の考えや観念に依って、次の行動を取ることを決定する。この全過程こそが意根の思心所の機能作用である。意根がまだ次にどのような行動を取るべきか決定できない場合には、やはり意識に再び情報を収集させて自分の参考に供させる。将軍が決定できないときに参謀に再びより多くの、より有用な情報を収集させ、詳細に報告させ、将軍が改めて決定を下せるようにするのと同じである。

このことから、疑を断ずる上で最も重要なのは意根の疑を断ずることであり、意識の疑を断じても意根の疑を断じなければ、意根にはなお疑いが残る。（ただし意識の疑については、意根が助けて解決することもある。）たとえば一家の主人に問題があるとき、家族全員が協力してその問題を解決しなければならず、彼の問題が解決されなければ、家族全体が正常で秩序ある運営をすることができない。

疑を断じて信を生ずる。疑を断ずるのも意根に断じさせることであり、信を生ずるのも意根に信を生じさせることである。最初は意識の信であり、意識の信は迷信・仰信・寵信であって、安定しない信であり、正信ではない。正信・深信とは意根の信であり、この種の信は根深く固く、揺るぎないものである。意根に信がなければ、自ら進んで正法を修学しようと思うことはできない。意識がどれほど信じていても、意根が疑いを生じれば意識にはどうすることもできず、意根の考えに従うしかない。意識は意根の参謀になることしかできず、意根という将軍を代表して決定を下すことはできない。そして如来蔵 (tathāgatagarbha) と意根の関係は父子の関係のようなものであり、意根という息子が何をしようと望んでも、如来蔵という父親には財力・物力・人力さえあれば、神様はすべて随順して満たしてくださる。