如来蔵には地水火風の四大種子が存在し、それらを異なる比率で分配して根身器界を構成します。地の種子が多く分配され比率が高ければ、物質は堅硬性を帯びます。水の種子が多く比率が高ければ、物質は柔軟で湿潤性を呈します。火の成分が多ければ物質は熱量を有し、風の成分が多ければ物質は軽軟で流動性を備えます。故に如来蔵が我々の骨格・爪・髪・筋肉・腱を造る際には、地の種子を多く分配します。その分量を如来蔵は知悉していますが、我々には分かりません。
当時まだ我々という存在は形成されておらず、如来蔵の創造に依存していたためです。意識心が生起する前であり、仮に現在意識が存在しても依然としてこの理を理解できず、無明の状態にあります。ただ如来蔵のみが業種を了別し、この事実を知っています。他の水・火・風の種子の分配量についても同様に認識しており、誰かに教示されることなく、指揮されることもありません。全ては如来蔵が業種を了別することで、これらの所作を成し遂げるのです。血液・脳髄・脊髄を造る際には、水の種子を多く分配し、他の種子を適切な比率で配合します。これら一切を如来蔵は知悉しています。
何時何を創造するか、どの部位に何を配置するか、いかなる形状・色彩を付与するか、人形・畜生形・非人形の別、識心が生起する時期、胎児が完成し出産すべき時機、出生後の色身五陰の諸相とその変化、成長過程と形態、疾病の発生時期、老衰相の現れる時期、それに応じた老衰の顕現、死期の到来と臨終前兆の示現──これら一切を如来蔵は知っています。
更に色身を離脱する時機、生じる中有身の形態、衆生がどの趣に転生すべきか、いかなる父母と因縁を結ぶかを知悉しています。我々の知らない一切を如来蔵は知っています。宇宙器世間の創造方法、山川河海・花草樹木の生成原理、宇宙器世間の壊滅時期とその様相──何一つとして知らないことはありません。我々自身を省みれば、究竟的に知っていることなど無明の闇に包まれています。これが如来蔵の智慧境界です。一切法に迷うことなく、一切法を覚知し、一切法を念じ、一切法を変現します。その功徳作用は無量無辺であり、成仏して初めてこれらの法を悉く了知するに至るのです。
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