如来蔵は、衆生の果報を直接実現することができ、意根の思心所を経る必要はありません。如来蔵は直接に業因果報を実現し、七識によって主導されません。如来蔵は直接に色身を成長させ、老いさせ、七識によって主導されません。如来蔵は直接に相応する果報の色身と生存環境を変現し、七識によって主導されません。
衆生が今生で造作する業行は、如来蔵が全て貯蔵します。身口意の一つ一つの細かい点を含め、微細な点も残さず、全て業の種子の形で記録・貯蔵されます。後世で縁が熟すると、如来蔵が業の種子を出力し、衆生は自身の業の種子に従って事を行い、報いを受けます。
これらの業の種子は全て意根と相応します。なぜなら意根は生々世々存在して滅せず、常にこれらの業を未来世に持ち続け、報いを受け終わるまで、業の種子が消失するからです。一方、六識は新たに生じるもので、業の種子を持ちませんが、意根に染まって様々な習気や煩悩を現すことになります。
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