五蘊十八界の働きは、すべて如来蔵が送り出す七大種子の功能作用です。七大種子が六根六塵の上で働くこと、地水火風空が色身の上で働くこと、そして識種子が識心の上で働くことは、いずれも五蘊の働きの中に現れています。識種子・四大種子・空大種子・見大種子が共に働くと、五蘊が生じます。如来蔵が種子を送り出すと、種子の功能作用が形成されます。種子の功能作用はすなわち如来蔵の功能作用でもありますが、如来蔵とはまた異なっており、両者は不一不異の関係にあります。如来蔵そのものが具えている種子が一切法を幻化します。種子と一切法はいずれも如来蔵に属しており、如来蔵は収めたり放ったりすることができるので、一切法はすべて如来蔵のものなのです。
しかし如来蔵には七識のような心行がなく、完全に無我性であり、いかなる一法にも執著せず、心地は本来清浄 (viśuddha/pariśuddha) です。ところが意根は、如来蔵が幻化したすべての一切法を、我・我の・我所有のものであると執著し、六識の功能作用を我と我のものと執著して、それらがすべて如来蔵が生んだものであり、如来蔵に属することを知りません。神様は如来蔵が幻化した法を執著しながら、如来蔵の存在と幻化作用を知りません。如来蔵は業種業縁に依って五蘊十八界を出生させ、神様の働きによらない法は一つもありません。しかし意根はそれらがすべて自分の所有物であると思い込んで貪著し、その貪執性のために三界の中に纏わりつかれ包み込まれて、出離解脱を得ることができません。纏わりつかれ包み込まれているのは意根であって六識ではなく、意根が万法を離さずに抓み取っているからです。
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