如来蔵 (tathāgatagarbha) の識の種子が出生して七つの識を形成し、七つの識が一たん現行して働き始めると、心所法の形で運行します。まず五遍行心所法があり、次いで五別境心所法が不定時に随って運行し、また善悪の心所法も随って運行します。七つの識は時に善、時に悪、時に善悪とも現起しませんが、五遍行心所法は必ず時時刻々七識に随って現前して運行します。ところがこれらの心所法には種子がなく、七大種子の中には五遍行の種子がなく、業種の中にも心所法の種子はありません。しかし七識が一たん現行すると、五遍行・五別境と善悪の心所が随って出てきて運行し、そこに身口意の業行が生まれてくるのです。
識の種子は水滴のように、水滴が連続して水流を形成し、その水流は七識の識流に相当します。しかし七識そのものは心所法に依拠してはじめて働くことができ、心所法の補助による運行があってこそ七識の功能作用があるのです。七識が出生すると、対応する法に対して作意・触・受・想・思を行います。これが七識の運作過程であり、その中にはその他の心所法が入り混じっています。識の種子そのものは清浄 (viśuddha/pariśuddha) であり、形成される識流も清浄ですが、心所法が運行に参与するとき、七識は必ずしも清浄であるとは限りません。心所法には清浄でないもの、染汚したものがあるからです。そうすると、七識が心行を帯びて形成した業種も、必ずしも清浄であるとは限らなくなります。如来蔵にどのような業種が蓄えられているかに応じて、意根にはそれに応じた現れがあり、それゆえ意根は必ず業種と相応するのです。
如来蔵は業種に基づいて七識を現行させます。業種が染汚していれば、七識の心行も染汚し、業種が清浄であれば、七識の心行も清浄です。染汚の種子が成熟すると、意根は染汚の業を現行させ、その染汚業はまた種子として如来蔵に蓄えられます。一方、識の種子は如来蔵に戻れば、やはり清浄のままです。七識が造作した悪の業種は縁が熟したときに現報となり、その現報の中でまた不善の心行が生じ、その不善の心行に依ってまた不善業を造作し、さらにこれを因として不善の果が生じます。業果はこのように周而復始し、衆生は輪廻して絶えることがありません。七識が造作した善悪の業種は縁に遇って現行して終わり、業種は消失しますが、一切の法、一切の心行はすべて档案(記録)のように決して消失しません。衆生が無始劫以来に経験したことが多ければ多いほど、この如来蔵にはそれだけ多く蓄えられ、歴劫の生命の長河の中のものは一粒一粒、如来蔵はすべて記録として保存します。如来蔵は無形無相であり、もし無形無相でなければこれほど多くの記録を保存することはできません。それゆえ記録もまた無形無相なのです。
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