意根にも自証自証分が存在します。観察する際には、まず意識が観察を行い、意根は意識の観察に基づいて自らの観察を行い、さらに思量を加えます。これにより独自の知見が生まれ、結論が導き出されます。全ては意根の結論を中心に展開します。意根は第八識を依り所として、第八識が幻化した一切の法を見出し、これらの法に対して自らの知見と見解を生じさせます。意根が理解できない法については六識を通じて理解し、六識が理解した内容に基づいて再び思考判断を行い、自らの見解と知見を形成します。
意根は我と我所の概念について明確な認識を持たず、具体的な概念さえほとんど存在しません。意根は機能作用に着目し、五蘊十八界の機能作用、自らの機能作用すらも執取しますが、意根自体の概念を形成しません。この点が意識との大きな差異です。意根が五蘊の我を認めない状態には、意根自身の機能作用をも認めない状態が含まれます。ただし初果の段階における無我の認識は二果ほど明確深遠ではなく、二果は三果に及ばず、三果は四果に劣ります。故に初果では法眼清浄を得て執取性が減退しますが、二果・三果ほどの軽微さには至らず、四果に至って初めて一切の執取性が消滅し、五蘊十八界への執着、意根自身の機能作用への執着さえも放棄するに至ります。
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